肿瘤突变负荷高低说明了什么?一文读懂标志物

2022-07-26

肿瘤突变负荷(Tumor Mutation Burden, TMB)通常指一份肿瘤样本中(肿瘤组织或外周血)全外显子测序或靶向测序所检测基因区域每兆碱基中发生的体细胞非同义突变或所有突变的数目(计算公式即:突变个数/检测的外显子Mb长度)。TMB计算的体细胞突变包括点突变和插入/缺失突变,去除驱动突变(与肿瘤治疗、诊断、预后密切相关的突变,包括热点突变、药物靶点突变、癌基因功能激活突变和抑癌基因功能失活突变)。由于TMB计算去除了可能影响免疫治疗效果的驱动突变,在极端情况下不排除出现 TMB=0 的可能。因而TMB = 0 仅表示检测样本在本产品的 TMB 分析方法的结果,并不等同于检测样本中没有突变。

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肿瘤突变负荷(TMB)作为一个潜在的生物标志物而出现。在不同的癌症中体细胞突变的数量从0.01突变/Mb~超过400突变/Mb不等。而这些突变中有些会转录表达多肽抗原表位或肿瘤新抗原。早期关于TMB的研究都是采用全外显子(WES)测序方法对肿瘤DNA和对照的胚系DNA进行分析。

虽然一些指南如欧洲临床肿瘤学会(ESMO)已经在指南中纳入了TMB作为可能的生物标志物,但TMB仍然存在有一定的争议,如在评估OS方面,TMB尚未有足够的证据以支撑其作为可靠的生物标志物。在突变发现方面也还没有相应的标准。在不同肿瘤类型或免疫疗法中分析方法和TMB阈值的差异,也让该生物标志物变得扑朔迷离。不同的算法也会影响TMB的预测值,因为算法在不同的基因检测panel中差异非常大,并且用于评估TMB的突变类型在各种检测方法中也有所差异。在很多采用WES的分析中,TMB只包含错义突变,而没有纳入其他突变类型。特别是,在福尔马林固定石蜡包埋样品处理方法的不同也能够很大程度上影响TMB的值。

TMB 可以间接反映肿瘤产生新抗原的能力和程度,预测多种肿瘤的免疫治疗疗效

TMB 水平分为:

TMB 低 (1-10mutations/MB)

TMB 中等(10-19 mutations/MB)

TMB 高 (≥ 20 mutations/MB)

外周血中的TMB值与组织中的TMB值存在一致性。

研究表明,高TMB与更好的生存期相关,在大多数癌症中,TMB越高,对免疫检查点抑制的应答反应就越好。TMB可以作为潜在的泛癌生物标志物。

TMB指标也存在缺陷,因为存在一些高TMB的患者对免疫治疗并不响应。这是由于高TMB并不意味着一定存在高肿瘤新生抗原,因而科学家引入了TNB这个概念。肿瘤新生抗原负荷 (Tumor Neoantigen Burden,TNB)是反映肿瘤细胞中总的新生抗原数量的一个指标,通常以每百万碱基(Mb)的肿瘤基因组区域中包含的肿瘤新生抗原数量来表示,TNB指标基于肿瘤新生抗原预测软件流程结果给出,可作为TMB指标的一个辅助指标。Clonal TNB 水平高的肿瘤患者,代表其肿瘤细胞表面的肿瘤新生抗原数量越多,免疫细胞能对肿瘤细胞产生更有效的杀伤作用,预示着 TNB 水平高的肿瘤患者,能对免疫检查点抑制剂药物有更好的治疗响应。

总之,TMB是一个在临床实践中尚存争议的一个生物标志物。在评估OS方面,TMB可能还不如PD-L1和微卫星不稳定(MSI)。科学界应该倡议进一步通过前瞻性临床试验验证OS作为衡量基点而非OR或PFS,并设计系统疗法和已知能改善OS的一线治疗方案进行比较。

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